Ситуационный отчёт

С мая местные медработники ежедневно обходят дома в ДРК: консультируют жителей, узнают о выздоровевших и умерших, а людей с подозрительными симптомами направляют за медицинской помощью.

В таких вспышках блокнот медработника часто становится первой и самой полной записью о том, когда человек заболел, с кем контактировал и где побывал до появления подозрений на инфекцию. При нынешней вспышке BDBV умерли почти половина из примерно 8 000 подтверждённых пациентов. От того, насколько быстро заболевшего обнаружат — до критического ухудшения состояния, когда лечение ещё может помочь, — часто зависит его выживание.

Когда появится вакцина, те же сведения о контактах помогут определить, куда её нужно доставить. Чем быстрее и точнее специалисты понимают, кто подвергся воздействию вируса, тем раньше они могут найти и защитить людей — ещё до того, как те заболеют. Однако скорость реагирования зависит от того, как быстро данные проходят всю цепочку: от блокнотов медработников до лабораторий, подтверждающих диагнозы, а затем до министерств и фондов, распределяющих ресурсы.

Лечебный центр Рвампара

Источник: anthropic.com

Как собирают данные

Медучреждения отправляют информацию о случаях в районные органы, часто через WhatsApp, а биологические образцы передают в местные лаборатории для секвенирования. Каждый район переносит сведения о заболевших на слайды PowerPoint и отправляет их в координационный центр по борьбе со вспышкой.

В провинциальном министерстве здравоохранения сотрудники, составляющие отчёты, допоздна сводят эти данные в презентации. Из таких презентаций формируется публикуемый оперативный отчёт — ситреп.

Недавно подготовка ситрепов и сама работа по сдерживанию вспышки в восточной части ДРК начали меняться. Этому помогло партнёрство, организованное Коалицией за инновации в сфере готовности к эпидемиям (CEPI) совместно с Африканским региональным бюро ВОЗ (WHO AFRO), Национальным институтом биомедицинских исследований ДРК (INRB) и другими организациями.

Партнёры работают с командами Anthropic по полезному применению технологий и прикладному ИИ. Claude используют для анализа полевых данных от местных медработников, систематического наблюдения за научными данными и их проверки, а также в научном рабочем инструменте.

По словам одного из специалистов, за 50 лет борьбы с вирусом изменились инструменты, но не принцип: победить Эболу можно, только понимая, где вирус находится сегодня, а не где он был неделю назад.

Ситрепы за час

Центр экстренной помощи WHO AFRO находится в Дакаре, Сенегал. Команда реагирования работает примерно со ста событиями в сфере общественного здравоохранения в год и часто выезжает в пострадавшие регионы, чтобы собирать данные и выстраивать рабочие процессы.

Тендай Муза занимается системами данных и аналитикой в WHO AFRO. Вместе с коллегами Тамаи Мландой и Джанни Донкором он создал навык Claude, ускоряющий подготовку ситрепов.

Claude извлекает из презентаций каждого медицинского района данные о случаях и лабораторных результатах, сверяет их с отчётом за предыдущий день, отмечает изменения в динамике и объясняет, что может за ними стоять, а затем обобщает районные отчёты. Раньше на подготовку ситрепа уходил целый день, теперь она может занимать менее часа.

Помимо подготовки ситрепов, команды по работе с данными используют Claude для анализа и моделирования распространения болезней. Пол Оума из команды WHO AFRO рассказал, что раньше специалисты из-за нехватки времени могли выбрать только одну модель и не успевали сравнить альтернативы. Теперь они запускают сразу несколько моделей и строят прогнозы. Например, это помогает сотрудникам, отвечающим за логистику, решать, где размещать лечебные центры.

Поиск вакцины

Одобренной вакцины против BDBV пока нет, но существует вакцина Ervebo против заирского штамма вируса Эбола. После появления BDBV CEPI предложила исследователям представить проекты по развитию потенциальных кандидатов и связанных с вакцинами научных направлений.

Полина Брангел, руководитель направления инноваций в данных для исследований и разработок CEPI, подчеркнула: Claude не решает, какие когорты серологических образцов нужно анализировать, чтобы получить данные о потенциальной перекрёстной реактивности Ervebo против BDBV. Это научное решение по-прежнему принимают специалисты.

Сейчас Claude организует сложные данные с множеством факторов так, чтобы человек мог сравнить большое число предложений и сделать выводы за гораздо меньшее время.

CEPI использовала Claude для создания панели мониторинга. Она помогла быстрее и надёжнее отслеживать действия и задачи команд, необходимые для продвижения разработки вакцины.

По словам представителей проекта, эта работа позволила в реальном времени понять, где ИИ может практически помочь командам, работающим в условиях давления.

Анализ генома вируса

В лабораториях, где образцы от медработников секвенируют для подтверждения случаев и отслеживания изменений вируса, результаты часто задерживаются на этапе компьютерного анализа генетических данных — биоинформатики.

Изучение генома вируса помогает установить, какие случаи связаны между собой, распространяется ли инфекция по невыявленным цепочкам, которые не видны в статистике заболевших, и меняется ли вирус так, что это может снизить эффективность тестов, лечения или вакцин.

Лаборатория INRB получила практически все геномы BDBV, секвенированные из образцов заболевших в ДРК во время нынешней вспышки. Каждая секвенирующая машина производит миллионы коротких фрагментов генетического кода. Раньше для сборки из них полного генома вируса специалистам приходилось вводить специальные команды в терминал программиста.

Работа с образцами в перчаточном боксе

Источник: anthropic.com

Claude Science — научный рабочий инструмент с ИИ — позволяет на естественном языке попросить систему собрать геном и построить родословное дерево вируса. Во время крупных вспышек специалистов по биоинформатике обычно не хватает, поэтому Claude Science снижает порог для получения анализа, который помогает отслеживать новые заражения. Инструмент также может оценивать масштаб вспышки и выявлять новые варианты вируса.

Другие вспышки

WHO Africa уже рассматривает возможность применять эти инструменты при других вспышках. Во время вспышки чикунгуньи — изнурительного заболевания, которое переносят комары, — специалисты используют Claude, чтобы очищать и проверять списки случаев. Такие списки описывают вспышку по трём параметрам: человек, место и время. Без ИИ эта работа заняла бы значительно больше времени.

Тренировка по мытью рук, больница Китатумба

Источник: anthropic.com

Следующей задачей команда ВОЗ видит объединение исторических баз данных о заболеваниях. Это позволит принимать решения во время новой вспышки с опорой на опыт предыдущих. Раньше свести такие данные в разгар кризиса было слишком сложно и долго.

Глобальные партнёры начинают понимать, как ИИ-инструменты могут приносить наибольшую пользу во время вспышек. Борьба с лихорадкой Эбола Bundibugyo ещё не завершена и потребует времени, хотя в провинции Итури появились признаки замедления распространения болезни. Команды реагирования продолжают проверять на практике, как ответственно и полезно применять ИИ в ситуациях, когда счёт идёт на время.